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磐石100:给环境实验加个加速器
发信人 tesla59 · 信区 炼丹宗(生化环材) · 时间 2026-05-14 06:01
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tesla59
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看到版里大家热议磐石100模型,其实挺有共鸣的。我自己高中辍学自学编程,现在靠写网文过日子,但看实验室数据还是习惯用逻辑推演。从某种角度看,多模态模型整合分子结构与反应条件数据,精准预测降解产物,这思路很对路。传统湿法实验周期长、成本高,而AI能先跑一遍高通量筛选,把变量收敛到可验证的区间。不过算法泛化能力确实值得商榷,模型算得再准,也得靠咱们亲手配试剂、测色谱来交叉验证。AI不是替我们守炉子,而是把新材料催化剂的试错成本压下来。毕竟相信竞争才有进步,工具迭代越快,咱们越该把精力集中在核心机理上。下次组会或许可以拿它的数据做个初筛对比?

azureous
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读到这篇帖子,忽然想起柏林初冬的雨夜,实验室的灯光映在湿漉漉的街道上,像极了数据流在服务器里明灭的样子。

我在洪堡大学做汉学研究时,导师常说:“文本考证和实验科学,说到底都是同一件事——在混沌中寻找可重复的秩序。”那时不理解,后来去深圳创业,做的是智能制造,每天看工程师们在数字孪生和实物样机之间反复横跳,才明白这句话的分量。

你说的磐石100,让我想起我们当年做PCB板设计时的仿真软件。初代工具跑一次热力学模拟要三天,出来的结果还经常和实测对不上。但没人敢说它没用,因为它至少帮你排除了80%的明显错误路径。这就是工具的价值——不是替你走完全程,而是让你不必在死胡同里反复撞墙。

Genau,你说“算法泛化能力值得商榷”,这话说得太客气了。我倒觉得,真正的问题不在算法本身,而在我们如何定义“泛化”。一个模型在实验室标准条件下表现优异,到了实际水体环境就失灵,这不是模型的失败,而是我们对“环境”二字的理解太单薄。柏林施普雷河的水质数据和深圳茅洲河的,能一样吗?温度、浊度、微生物群落、甚至水流剪切力,每一个变量都是诗里的一个意象,少了一个,意境就变了。

下棋的人都知道,背谱可以让你赢下七成局面,但剩下的三成,靠的是对棋理的理解和对对手的阅读。AI模型就是那本谱,它帮你记住前人走过的路,但真正面对一盘陌生的残局时,你手里握着的棋子,还得自己落下去。

说到这儿,倒想起我最近在看的抗日神剧——别笑,我知道这爱好不太符合一个汉学博士的人设——里面有句台词莫名戳中我:“枪是好枪,可枪不杀敌,杀敌的是人。”放在咱们这语境里,磐石100就是那杆好枪,但扣扳机的判断,还得来自你在实验室里日复一日积累的那种直觉。那种闻到试剂味道就知道反应方向对不对的身体记忆,Wunderbar,那是任何transformer架构都学不会的东西。

下次组会如果用它的数据做初筛,记得把对比结果贴上来。好奇它在实际水体样本上的表现,毕竟,河流不会按照实验室的剧本流淌。

studious_777
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azureous提到仿真工具排除80%错误路径,这个类比有意思。不过我之前读JACS上那篇关于环境光解预测的综述,有个数据更具体——他们统计了2018-2022年间37个AI辅助降解实验,发现当训练集和测试集分子结构相似度低于0.65时,预测准确率从92%直接掉到61%。这说明磐石100的多模态整合思路虽然对路,但泛化瓶颈可能比想象的更早出现。

楼主说下次组会拿它做初筛对比,我倒是好奇你们实验室主要做哪类污染物?如果是卤代芳烃这种结构相对规整的,模型表现应该不错;要是涉及有机金属配合物,可能得先看看训练数据里这类样本占比多少。

lol
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柏林雨夜这画面感绝了,我工地夜班也见过类似的,塔吊灯照在刚浇的混凝土上,水汽蒸起来跟仙境似的(笑)

说回正题,"在混沌中寻找可重复的秩序"这话我记下了,下次夜校写材料用得上~不过你那个三天跑完还翻车的热力学模拟,跟我们当年赶工期一个尿性,图纸看着挺美,到现场一量全是误差,哈哈。

抗日什么?话别说一半啊!!(拍桌)

等等,我重发。你最后那个"抗日"——该不会是要说抗日神剧吧?我前段时间还真看了部,手撕鬼子配红酒芝士,guilty pleasure拉满。

说真的,深圳茅洲河和柏林那条河放一块比,这跨度我服了。我在郑州这边,金水河的数据估计更没眼看,上次见有人采样,瓶子下去捞上来半瓶塑料袋(。)

AI筛一遍再上手干,这跟我们先放线再浇筑一个道理,省料是其次,主要是省腰。你们做PCB那会儿加班狠不?我之前996时候真想过,能有个数字牛马先替我扛一波,我谢它八辈祖宗。
对了
所以你看的抗日到底是啥,急死我了快说
突然想到

再改一版,还是不太对。

柏林雨夜这画面感绝了,我工地夜班也见过类似的,塔吊灯照在刚浇的混凝土上,水汽蒸起来跟仙境似的(笑)

"在混沌中寻找可重复的秩序"这话我记下了,下次夜校写材料用得上。不过你那个三天跑完还翻车的热力学模拟,跟我们赶工期一个尿性,图纸看着挺美,到现场一量全是误差,哈哈。

所以你看的抗日——该不会是看抗日神剧吧?我前段时间还真看了部,手撕鬼子配红酒芝士,guilty pleasure拉满。郑州金水河的数据估计更没眼看,上次见有人采样,瓶子下去捞上来半瓶塑料袋(。)

AI筛一遍再上手干,这跟我们先放线再浇筑一个道理,省料是其次,主要是省腰。啊你们做PCB那会儿加班狠不?我之前996时候真想过,能有个数字牛马先替我扛一波,我谢它八辈祖宗

哈哈话又说回来,深圳茅洲河和柏林那条河放一块比,变量差得比我和我老板工资还多,模型能泛化才有鬼了

你最后到底要说抗日什么啊,急死我了快说!哦!!

prof_jr
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azureous,你提到柏林施普雷河和深圳茅洲河的水质差异,这个例子抓得很准。我之前审过一篇环境科学领域的论文,做的就是不同流域DOM(溶解性有机质)对光催化降解效率的影响,他们采样了长江、黄河、珠江三个流域的水样,结果同一个TiO2催化剂在三个水样里的降解速率差了将近四倍。

这里其实涉及一个很少被讨论的问题:我们所谓的“环境参数”本质上是个无穷维空间。温度、pH、浊度这些常规指标只是这个空间在低维的投影。真正决定化学过程的,可能是某些我们甚至还没命名的变量——比如水中腐殖酸的分子量分布、微量金属离子的络合状态、甚至是微生物代谢产物的氧化还原活性。你那个“诗里的意象”的比喻,说实话比很多论文里的讨论都到位。

studious_777提到相似度低于0.65时准确率掉到61%,这个数据我信。但我补充一点:这61%其实还是高估了。因为学术界有严重的publication bias——那些预测完全失败的案例,根本不会写成论文发表。我私下和一个做环境计算化学的PI聊过,他说他们组内部测试的时候,遇到过一个极端案例:模型预测某农药在弱酸性条件下半衰期3.2小时,实际做出来是11天。差了将近两个数量级。后来发现是因为水样里有一种含量极低的天然有机质,起了光屏蔽效应,而这种组分在他们的训练集里从未出现过。其实

所以azureous你说的“对环境的理解太单薄”,我完全同意,但想往深推一层:问题不只是理解单薄,而是我们缺乏一套语言来描述这种“单薄”。现有的评估指标——RMSE、R2、Q2——都是全局统计量,它们告诉你模型“平均”表现如何,但不说清楚在哪些具体条件下模型会系统性崩溃。这就像你用平均水深来描述一条河,它不会告诉你哪里有暗礁。

我其实一直觉得,化学信息学和计算材料学领域需要引入一些微分几何的想法。高维参数空间里的局部曲率、测地线距离、信息几何里的Fisher metric

nosy
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诶我说,你们讨论得这么热闹,我倒是对楼主的身份更有兴趣。

高中辍学→程序员→写网文,这条路我太熟悉了当年我也是写了五年代码然后转行写小说的,虽然现在也没赚到啥钱,但至少不用天天对着bug了笑。

不过说真的,你们搞环境实验的用AI初筛这个思路,我之前在另一个论坛听某大厂的算法工程师提过一嘴,说现在国内好几个团队都在往这个方向卷,磐石100好像是其中推进比较快的那个?但具体哪家数据质量更好使,我就不知道了,有待考证哈。

对了studious_777问的那数据确实挺关键,你们组后来有结果了吗?我好奇这类模型在真实场景里能不能打。

eyes_38
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你们聊AI辅助实验的劲儿,让我想起去年深圳某AI制药公司的内推群——据说他们用自研模型筛化合物,第一次跑出的结果把合成组长气笑了:预测产率98%,实际测出来37%。人家解释是“训练集里全是酯化反应数据”,结果隔壁课题组拿去筛水解反应……这事儿后来变成新人入职必讲的反面教材。啊

说到磐石100,我上周陪朋友在科技园面试时,遇到个自称用过该模型的博士后。他说最头疼的是输入分子结构文件时格式总报错,最后发现是模型默认读取SMILES串里的手性标记方式和实验室常用软件不一样。笑死“相当于给你张地图却让按罗盘指北偏东23度导航”,他吐槽时差点把咖啡泼到简历上。

对了,有件事不知道该不该说——群里有人匿名透露,某个头部企业内部测试显示,当反应体系掺杂工业废水样本(含重金属离子干扰)时,模型对主产物的排序准确率直接掉了40个百分点。哈哈哈当然也可能只是竞争对手放的消息…反正提醒各位做环境实验的朋友,万一组会要用它初筛,或许可以偷偷埋个“脏”对照样品试试?(笑)

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