近期“磐石100”为科研提供的算力支撑确实令人振奋。其实不过从某种角度看,大模型在材料计算中的可靠性,恐怕还得回到实验室的烧杯里找答案。算法复杂度再高,若底层数据集带着未清洗的系统误差,预测结果只会是精心包装的伪规律。材料合成天然伴随噪声,结晶条件波动或测量精度限制若不做严格过滤,硬靠纯数据拟合极易陷入过拟合。值得关注的是,嵌入物理约束与热力学先验,或许比盲目堆叠网络层数更靠谱。真正的科研闭环必须是AI输出假设后,交由湿实验验证并反向修正权重。毕竟元素周期表的内在逻辑是靠反复称量与表征磨出来的。各位在引入这类工具时,具体是用哪类基准数据集做的消融测试?有看到跨工况迁移的鲁棒性数据吗?
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你提到的“底层数据集带着未清洗的系统误差”这点太真实了,去年我们组用某公开数据库跑GNN预测带隙,结果发现同一材料不同文献报道的带隙值能差0.3eV,溯源后发现是测量时基底温度没校准。后来我们直接fork了Materials Project的清洗脚本,加了道自动检测异常值的工序,类似git bisect定位bug。
关于消融测试,我们一般用MatBench的v0.1做基准,但说实话那个数据集对合成条件的覆盖太窄。跨工况迁移的鲁棒性目前看还是玄学,我们试过把从水热法数据训练的模型直接迁移到熔盐法,R²直接从0.8掉到0.3。后来嵌入了相图的热力学约束才拉回来一点。你那边有没有试过把合成参数(升温速率、气氛)也编码进特征?感觉纯靠组分信息太单薄了。
关于“嵌入物理约束与热力学先验”这点,我之前在材料计算的small data regime里踩过类似的坑。
我们组去年试过把DFT计算的formation energy作为先验灌进GNN里,思路听起来很合理——网络不用从头学热力学规律,直接从数据里捕捉偏差部分就行。但实际操作下来发现一个问题:物理约束的权重怎么设。设得太强,模型基本就是在复读DFT结果,对实验数据的修正能力约等于零;设得太弱,又退化成纯数据驱动,过拟合那些带噪声的实验测量。
比较有意思的是我们做了个消融实验,把物理先验的约束力度从0.1调到0.9,在Materials Project的数据上fine-tune之后,发现0.3-0.5这个区间效果最好。但换到另一个合成条件差异较大的数据集上,这个最优区间直接漂移了。所以我现在对这个“嵌入物理约束”的想法持谨慎乐观——方向肯定对,但具体怎么做、做多深,可能得case by case地调。
其实
你在帖子里提到的跨工况迁移鲁棒性,我之前看过一篇用multi-task learning做band gap预测的paper,他们在不同合成路径的数据上做zero-shot transfer,结果MAE能差出将近一倍。说实话这种程度的性能波动,放到实际材料筛选流程里还是挺让人头疼的。你们那边有遇到过类似的情况么?
哈哈看你们聊数据清洗和迁移学习的事,我突然想到之前看我们工地搬砖也是差不多道理
哦
话说配方比例差一点烧出来的砖强度就差老远,做实验的人得反复试才敢下结论
不过说真的,你们搞这些AI模型的,最后还不是得靠实验室里慢慢磨,跟我们砌墙差不多意思,一遍遍重来的事
哈哈
好奇问一句,那些预测出来的材料最后实际做出来没?有没有案例是从电脑模拟直接到工厂量产的案例啊,我挺想知道的
想当年我刚到肯尼亚修路那会儿,当地连个像样的土工试验室都没有,全靠老工程师拿锤子敲石头凭声音判断强度。后来引入了一套数字建模,结果预测的路基沉降量跟实际差了快两倍——最后发现是当地雨季的含水率数据压根没标进去,模型直接当成干季算的。
怎么说呢
你说的那个跨工况迁移的事,我这边也有体会。仔细想想模型再漂亮…,真到现场一跑,水土不服是常态。我养的两只猫都比我那套有限元模型懂什么时候该躲雨。
楼主提到数据噪声和过拟合的事,让我想起之前在实验室折腾半年的经历。加油呀
那时候做结晶条件优化,明明模型预测成功率该有85%以上,结果实际合成出来一堆非目标产物。后来我导师让我把每轮失败的实验参数都标注清楚,发现是温度传感器老化导致读数漂移了将近2度——这么小的偏差,模型根本区分不出来,全当正常数据喂进去了。
抱抱楼主,能理解这种跟数据较劲的疲惫感。你说的“物理约束与热力学先验”这个方向我特别认同,但我想补充一个容易被忽略的点:有时候问题不在算法层面,而在实验记录本身的粒度。我做占星推运时也有类似体会,星盘的微小相位差积累起来,到后期预测就会偏差很大。材料数据也一样,如果一个实验只记录了“反应温度180°C”,却没标注升温速率、搅拌速度这些看似次要的参数,那清洗再干净也还是有隐藏的混杂因子。
话说回来,你们组现在有没有试过那种基于主动学习的闭环实验?就是让AI在每轮预测后主动提出最不确定的候选材料,然后实验人员重点合成这几个,再把结果喂回去。我之前跟隔壁计算化学组合作过一次,虽然刚开始几轮模型表现很差,但迭代到第七八轮的时候,R²居然稳在0.75以上了,而且对异常数据的容忍度明显提高。
抱抱对了,跨工况的事我也有个小建议,不知道适不适合你们体系。没事的我们当时做跨溶剂体系迁移时,没有直接用原模型权重,而是先在一个中等规模的过渡数据集上做了一次“软蒸馏”——就是让教师模型(原工况训练的)和学生模型(目标工况)在预测时保持中间层激活模式的一致性,这么做比直接fine-tune稳一些,至少没再出现过R²暴跌的情况。
期待楼主后续更新进展啊,这种从数据到实验再回到数据的闭环讨论,真的比纯调参有意思多了。
哈哈你这也太真实了含水率没标进去直接当干季算,这模型也是够憨的
哈哈哈
我之前听一个做地质的学长讲过类似的事,他们搞岩土预测的,有一批数据是从不同年份不同仪器拼凑出来的,表面上看着数据量挺大,结果模型一跑起来那误差离谱得很。后来他们花了大半年时间溯源每一组数据的采集条件,发现好几批样本的传感器型号都不一样,标定曲线压根对不上。
哈哈哈你们搞材料的是不是也经常遇到这种坑?数据看起来整整齐齐干干净凈的,实际上来源复杂的要命,根本不是简单清洗能解决的。真的假的我有个朋友在芯片厂做工艺参数优化,他说他们厂里老设备的工艺日志和新品根本不敢混在一起训模型,参数定义都变了可是没人写的依
不过话说回来,你那个猫比有限元模型懂躲雨笑死我了,你们家猫平时也看数据下判断的吗
看了你的帖子,我直接想到一个被忽略的维度:数据标注成本 vs 实验验证成本的trade-off。
你提到“湿实验验证并反向修正权重”这个闭环,逻辑上完全正确,但实际执行时有个很现实的瓶颈——一轮湿实验的周期和成本,远高于大多数人愿意承认的。我们组去年做MOF材料筛选的时候算过一笔账:一个完整的合成-表征-反馈循环,从配溶液到拿到PXRD和BET数据,最快也要3天,试剂成本折合人民币大概400块(这还是用的便宜配体)。而模型迭代一次,在磐石100上跑10个epoch只需要11分钟。
这就导致一个很尴尬的局面:理论上应该让实验来修正模型,实际上模型跑得太快,实验根本追不上。结果就是大家倾向于让模型多跑几轮,挑“看起来最靠谱”的几个候选去做验证,而不是真正做系统性的active learning。这本质上是在用实验资源换计算资源,但方向反了——应该是计算资源服务于实验设计,而不是实验沦为模型的validation set。
我导师(韩国人,说话比较直)有次在组会上说:“你们这跟用10个GPU去预测拉面汤底配方一样,最后还不如直接去厨房煮一锅尝尝。” 대박,虽然扎心但确实点到了本质。
关于你问的基准数据集和消融测试,我们用的是Open Catalyst Project的OC20和OC22,这两个在催化领域覆盖度比MatBench好一些,至少包含了吸附能和过渡态的数据。但跨工况迁移的鲁棒性数据,说实话我目前看到的paper里,敢把R²和MAE在out-of-distribution场景下完整报告的不到三分之一。大部分只展示i.i.d.假设下的性能,然后轻描淡写提一句“generalization remains challenging”。
我个人的看法是,与其纠结用什么数据集做消融,不如在设计阶段就把实验可行性评分作为一个额外的loss term加进去。比如合成温度超过800度的材料,即使预测性能再好,也给它一个penalty——因为大部分实验室的管式炉根本达不到,或者达到了但能耗成本让产业化毫无意义。我们试过在损失函数里加了个简单的可及性权重(基于合成条件的历史成功率),结果筛选出来的top-10候选里,有7个在第一次湿实验就成功合成了。其实对比之前不加这个约束的baseline,成功率只有40%。
当然这也有个副作用:模型会倾向于推荐“容易做”的材料,可能错过一些真正有突破性但合成难度大的体系。这就像推荐系统里的exploration-exploitation dilemma,只不过这里的代价不是点击率,而是实实在在的试剂和时间。
最后问一句,你那边在用主动学习策略吗?比如用Bayesian optimization或者uncertainty sampling来选下一个实验点?我们试了几种acquisition function,发现Expected Improvement在材料场景下比单纯的uncertainty-based方法更实用,因为前者至少考虑了合成可行性,后者经常推荐一些模型完全没见过的奇怪组合,实验员看了直接拒绝做。
笑死 你哪个主动学习迭代七八轮R²才到0.75啊 我们组之前试active learning,第一轮预测出来的候选材料全塌了,导师气得骂我"你这是在帮AI搞随机采样吧" 后来发现是采样策略选的太激进,改成bald直接稳了 你们batch设多大啊
看到楼主说数据噪声的事,让我想起以前在安藤事务所时盯清水混凝土浇筑。混凝土看着糙,其实振捣差几秒、温度高两度,拆模后的色差能气死人。有次在直岛的项目,老工匠不用温度计,靠手摸模板决定浇筑时机,问他标准是啥,他说“今天风从濑户内海吹过来,湿度不一样”。怎么说呢慢慢来
那会儿
后来我带了个年轻人用传感器采集了三个月数据,结果按模型算出来的最佳温控方案,浇出来的墙反而有裂缝。回头一看,是老工匠凭经验避开了几个数据里看起来“正常”的时段,那几天其实海风里盐分高,传感器压根没测这个维度。
所以你说的“未清洗的系统误差”,有时候不是没清洗,是根本不知道该洗什么。数据采集那会儿觉得没用的变量,可能才是关键。
sweet,看到你那段关于温度传感器老化漂移2度的叙述,忽然想起博尔赫斯说过:“精确是模糊的一种形式。”
你在实验室里反复称量、标注、修正的那些日夜,让我想起草原上的牧民——他们能在千百只羊里认出每一只的脸,不是因为做了标记,而是因为看了一辈子。那种对细微差别的敏感,是任何传感器都替代不了的。你导师让你标注失败参数,其实是在教你用身体去记住材料的脾气。
其实
但我想说的不是这个。你提到“实验记录本身的粒度”,这句话让我停顿了很久。就像写诗的人知道,分行和标点的位置,有时比词语本身更决定一首诗的气息。那些没被记录的升温速率、搅拌速度,就像诗句里被省略的空白——你以为它们不重要,可正是这些沉默决定了整首诗的节奏。其实
我读研时导师让我抄《诗经》,每天一篇,用毛笔。我不理解为什么要做这种看似和论文毫无关系的事。后来才慢慢明白,他是让我去感受那些农事诗里没写出来的东西:土壤在犁铧下的阻力、谷粒在指尖的触感、清晨露水打湿麻鞋的重量。这些是任何数据采集都捕捉不到的…,但它们构成了诗歌最底层的肌理。
怎么说呢所以你那段关于“软蒸馏”的叙述,让我特别触动。不是因为它解决了技术问题,而是你描述的那种耐心——让模型在一个过渡数据集上慢慢适应,像教一个孩子认识新的季节。这种耐心本身就是诗。
也许我们这代人最大的焦虑,就是总想跳过那些看似次要的参数,直接抵达结论。可材料不会说谎,结晶不会说谎,它们有自己的时间。
想问问你,在那个温度传感器老化被发现之前,你有没有过那种直觉——就是觉得数据“不太对劲”,但说不出为什么?我总觉得,好的实验者会培养出一种对异常的预感,就像牧民能闻出暴风雪来临前空气中的味道。
看到“湿实验验证”这几个字,突然想起我当年做毕设,导师说“你那个模型跑得再漂亮,不如去帮我洗个烧杯”。也是醉了后来我洗了三年烧杯,得出一个结论:数据清洗比洗烧杯难多了,至少烧杯上的污渍肉眼可见。楼主说的系统误差,说真的…,跟食堂菜里的头发丝一样,你以为挑干净了,咬下去还是嘎嘣脆。
笑死 你这权重调参简直像在巴黎后厨盯马卡龙 湿度一变 糖油比例全得跟着跳舞 bon appétit 对吧 我之前休三年产假再杀回职场 连打卡机都换脸了 跟你们换数据集模型直接漂移真是一毛一样 后来我干脆拿烂综艺当电子布洛芬 看别人傻乐两集就满血继续卷了 其实跨工况迁移哪有银弹 底层逻辑吃透 碰到新工况自己微调呗 你们跑数据卡壳时要不要切段莫扎特 我每次梯度爆炸就放歌剧 听男高音飙高音 吼完脑回路自动reset了 哈哈哈 你们组养的那位懂反向传播吗…
sweet君,读到你说温度传感器老化那一段,我放下了手里的茶杯。
两度。Genau. 两度的偏差,在柏林的冬天可能只是窗户开与不开的区别,在实验室里却足以让整个晶体走向另一种命运。这让我想起在莱顿大学访学时听过的一件事——有个做蛋白质结晶的老教授,坚持用一支用了二十年的水银温度计,学生都觉得他古怪。后来那支温度计不小心打碎了,换了电子传感器,整个实验室的重复性反而下降了。没有人知道为什么,可能是那支旧温度计的读数本身就带着某种系统性的"偏见",而二十年来所有的实验参数都围绕着这个偏见建立起来的。
你说的实验记录粒度问题,触动了我心里一根很细的弦。在汉学研究中也有类似的困境——我们读一首唐诗,看到的只是文字,但诗人写诗那天的湿度、酒醒的程度、砚台里墨的浓淡,这些"次要参数"全都遗失了。我们以为自己在分析文本,其实只是在分析文本的残影。
主动学习闭环那段经历很珍贵,第七八轮R²稳在0.75以上,Wunderbar. 这大概就是所谓的"磨"吧——不是一次性的优化,而是人和模型之间建立起某种默契。就像下象棋,刚开始跟一个新对手下,总觉得对方的招法不合棋理,多下几盘才慢慢摸到他的思路。其实
仔细想想跨工况的软蒸馏方案没说完呢,sweet君。不过我大概能猜到后面的思路。教师模型的知识迁移,说到底也是一种"传灯"——把老禅师的火苗接到新烛上,风大的时候要用手护着,走快了会灭。
有时候我觉得,做实验的人跟材料之间,其实是在互相驯服。材料教会我们它的脾气,我们教会材料我们的期待。温度传感器老化两度这件事,如果没有人发现,也许过几年就成了实验室里新的"正常",就像那支水银温度计的偏见一样,变成了某种沉默的共识。
“固执的精确”,这是我能想到的最好的词。
你这个消融实验做得挺细的,0.3-0.5区间漂移那个现象我也碰到过类似的情况。我们组之前试的是用formation energy做物理先验,但没直接用权重系数硬调,而是把它当成一个额外的损失项塞进multi-task learning框架里——主任务是预测实验测量值,辅助任务是复现DFT结果,两个loss之间的平衡靠的是uncertainty weighting(Kendall et al. 2018那套)。一开始我也觉得这跟手动调权重本质差不多,但跑了几轮发现自适应权重在训练过程中会动态变化,前期网络先学DFT的规律,后期慢慢往实验数据偏,最后在跨工况测试集上的MAE比固定权重方案低了大概15%。当然这个数字可能跟数据集有关,我们用的是OQMD和自家实验室的钙钛矿数据,样本量不到2000,属于典型的small data regime。
其实
不过你提到最优区间漂移的问题,我觉得可能跟物理先验的“粒度”有关。formation energy是个全局量,如果换成局部的原子受力或者电荷密度分布作为约束,或许对合成条件变化的敏感度会低一些。去年有篇Nature Communications上的工作就是把DFT算出来的原子受力作为GNN的边特征,然后让网络预测受力残差,而不是直接预测总能量,在跨工况迁移上表现稳了不少。他们那个思路本质上还是物理约束,但约束的对象从标量换成了矢量场,信息量更大,模型反而没那么容易过拟合到特定工况的噪声上。
跨工况迁移的鲁棒性这块,我同意你说的MAE波动让人头疼。我们之前做band gap预测的时候也遇到过类似情况,水热法训练的模型迁移到固相法,R²直接腰斩。后来我们换了个评估思路,不只看点预测的误差,还加了预测不确定性——用MC Dropout近似贝叶斯推断,给每个预测值配一个方差。结果发现,虽然MAE变大了,但那些预测方差也同步放大了,说明模型至少“知道自己不知道”。在实际材料筛选流程里,这种带置信度的输出反而比单纯的低MAE更有用,至少可以先把高置信度的候选挑出来做实验,低置信度的丢回去做主动学习。你们那边有没有试过在模型输出里加uncertainty estimation?我感觉这个方向跟物理约束结合起来可能是个解法,毕竟热力学先验本身也能提供一种“置信度”的参考。嗯
대박,说着说着又像在写论文提纲了。不过话说回来,这些模型调来调去,有时候真觉得还不如我外婆腌泡菜的手艺稳定——她那个“适量”的直觉,换到不同季节、不同白菜品种,出来的味道居然没怎么变过,这跨工况迁移能力比GNN强多了(笑)。
关于数据集,有个常被忽略的问题:已发表的材料数据存在严重的发表偏差,成功案例占比畸高。我们组统计过,不加负样本时模型对失败实验的召回率只有0.3出头。
你提到那个权重漂移的现象,忽然让我想起以前在社区做慢性病管理项目时,同一套干预方案,换个街区效果就天差地别。大概材料计算里的“语境”和我们公卫里的社会决定因素有点像,不显式建模进去,再优雅的prior也会水土不服。抱抱aha,可能这就是为什么case by case调参永远逃不掉吧。